ssmuБюллетень сибирской медициныBulletin of Siberian Medicine1682-03631819-3684Siberian State Medical University, the Ministry of Healthcare of the Russian Federation10.20538/1682-0363-2014-5-67-72ssmu-223Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL PAPERSМОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE У ДЕТЕЙ КРАСНОЯРСКОГО КРАЯSTREPTOCOCCUS PNEUMONIAE MOLECULAR EPIDEMIOLOGICAL FEATURES IN CHILDREN OF KRASNOYARSK REGIONПротасоваИ. Н.ProtasovaI. N.

Протасова Ирина Николаевна — кандидат медицинских наук, доцент кафедры микробиологии

Protasova Irina N.

ovsyanka802@gmail.comБахареваН. В.BakharevaN. V.

Бахарева Наталья Васильевна — консультант-эпидемиолог биологии

Bakhareva Natalia V.

ovsyanka802@gmail.comПерьяноваО. В.PeryanovaO. V.

Перьянова Ольга Владимировна — кандидат биологических наук, доцент, заведующая кафедрой микробиологии им. доц. Б.М. Зельмановича КрасГМУ

Peryanova Olga V.

ovsyanka802@gmail.comЕлистратоваТ. А.YelistratovaT. A.

Елистратова Татьяна Анатольевна — студентка 5-го курса лечебного факультета

Yelistratova Tatiana A.

ovsyanka802@gmail.comКовальМ. В.KovalM. V.

Коваль Марина Викторовна - зам. главного врача

Koval Marina V.

ovsyanka802@gmail.comКрасноярский государственный медицинский университет им. проф. В.Ф. Войно-Ясенецкого; Российско-японский центр микробиологии, эпидемиологии и инфекционных заболеваний, КрасноярскРоссияKrasnoyarsk State Medical University named after Prof. V.F. Voino-Yasenetsky, Krasnoyarsk; Russia-Japan Center of Microbiology, Epidemiology and Infectious Diseases, KrasnoyarskRussian FederationМинистерство здравоохранения Красноярского края, КрасноярскРоссияMinistry of Public Health of Krasnoyarsk Region, KrasnoyarskRussian FederationКрасноярский государственный медицинский университет им. проф. В.Ф. Войно-Ясенецкого, КрасноярскРоссияKrasnoyarsk State Medical University named after Prof. V.F. Voino-Yasenetsky, KrasnoyarskRussian FederationКрасноярский краевой специализированный дом ребенка № 3, КрасноярскРоссияSpecialized Krasnoyarsk State Orphanage no. 3, KrasnoyarskRussian Federation2014281020141356772Copyright © Протасова И.Н., Бахарева Н.В., Перьянова О.В., Елистратова Т.А., Коваль М.В., 20142014Протасова И.Н., Бахарева Н.В., Перьянова О.В., Елистратова Т.А., Коваль М.В.Protasova I.N., Bakhareva N.V., Peryanova O.V., Yelistratova T.A., Koval M.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://bulletin.ssmu.ru/jour/article/view/223

Представлены данные обследования 250 детей в возрасте младше 5 лет, большинство из которых находились в детских организованных коллективах, и 215 детей школьного возраста с целью выявления носительства Streptococcus pneumoniae и изучения молекулярно-эпидемиологических особенностей штаммов, циркулирующих на территории Красноярска и Красноярского края. Данное исследование на территории региона проводится впервые и является обоснованием для выбора оптимальной стратегии вакцинопрофилактики пневмококковых заболеваний.

Идентификация S. pneumoniae проводилась как традиционными методами, так и с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) по наличию гена cpsA, определение серотипов осуществлялось с использованием мультиплексной ПЦР согласно международным рекомендациям.

Распространенность бактерионосительства среди детей младше 5 лет составила 51,6%, среди школьников – 12,1%. В возрастной группе детей младше 5 лет преобладали серотипы23F,19Fи 6В, большинство штаммов (до 90%) принадлежали к серотипам, входящим в состав пневмококковых вакцин, разрешенных к применению в Российской Федерации, наибольшее соответствие отмечалось у 13-валентной конъюгированной вакцины. Среди детей школьного возраста ведущую роль играли 6В, 9VA, 15АF, до 60% из них относились к серотипам, входящим в состав пневмококковых вакцин.

Учитывая высокий уровень носительства пневмококков, детям в возрасте младше 5 лет, находящимся в детских организованных коллективах, а также неорганизованным детям из семей с двумя детьми и более необходимо проведение специфической профилактики пневмококковых инфекций  с применением 13-валентной пневмококковой конъюгированной вакцины.

The purpose of the research was to estimate the prevalence of Streptococcus pneumoniae nasopharyngeal carriage in 250 children aged under 5 years and 215 school-aged children in Krasnoyarsk Region, and also investigate molecular epidemiological features of the strains circulating inKrasnoyarsk city and in Krasnoyarsk Region. This study is carried out for the first time in the region and provides a foundation for the choice of optimal vaccination strategy of pneumococcal disease.

S

S. pneumoniae identification was carried out using culture method as well as PCR (revealing of cpsA gene), serotypes were determined with PCR (according to CDC protocol).

The prevalence of S

The prevalence of S. pneumoniae carriage in under-five children was 51,6% with predominated pneumococcal serotypes 23F, 19F and 6В; most of these strains (up to 90%) belonged to those included in pneumococcal vaccines which are permitted for use in Russian Federation; the greatest conformity was observed in 13-valent conjugated vaccine. In school-aged children the S. pneumoniae prevalence was 12,1% with predominated pneumococcal serotypes 6В, 9VA and 15АF, most of these strains (up to 60%) belonged to those included in approved pneumococcal vaccines.

Considering high level of S. pneumoniae carriage in children under 5 years in organized groups and unorganized children from families with two or more children it is necessary to carry out vaccine prevention of pneumococcal diseases with of 13-valent pneumococcal conjugated vaccine application.

Streptococcus pneumoniaeсеротипыдетивакцинацияStreptococcus pneumoniaeserotypeschildrenvaccinationReferencesWorld Health Organization (2013) Progress in introduction of pneumococcal conjugate vaccine worldwide, 2000–2012 // Weekly Epidemiol. Rec. V. 88. P. 173–180. doi: 10.1371 /journal.pone.0081539.World Health Organization (2013) Progress in introduction of pneumococcal conjugate vaccine worldwide, 2000–2012. Weekly Epidemiol. Rec., vol. 88, pp. 173–180. doi: 10.1371/journal.pone.0081539.O’Brien K.L., Wolfson L.J., Watt J.P. et al. Burden of disease caused by Streptococcus pneumoniae in children younger than 5 years: global estimates // Lancet. 2009. V. 374. P. 893–902. doi: 10.1016/S0140-6736(09)61204-6.O’Brien K.L., Wolfson L.J., Watt J.P. et al. Burden of disease caused by Streptococcus pneumoniae in children younger than 5 years: global estimates. Lancet, 2009, vol. 374, pp. 893–902. doi: 10.1016/S0140-6736(09)61204-6.Артюхов И.П., Галактионова М.Ю., Рахимова А.Л. Основные тенденции состояния здоровья подростков города Красноярска // Сиб. мед. обозрение. 2012. Т. 6. С. 47–52.Artyukhov I.P., Galaktionova M.Yu., Rakhimova A.L. Osnovnye tendencii sostoyaniya zdorov'ya podrostkov goroda Krasnoyarska [The main trends of adolescent health of the city of Krasnoyarsk]. Sibirskoe medicinskoe obozrenie – Siberian Medical Review, 2012, vol. 6, pp. 47–52.Статистические данные Министерства здравоохранения РФ. URL: http://www.rosminzdrav.ru/documents (дата об-ращения: 05.03.2014).Statisticheskie dannye Ministerstva zdravoohranenija RF [Sta-tistical data of the Ministry of health of the Russian Federation] URL: http://www.rosminzdrav.ru/documents (дата обращения: 05.03.2014).Бахарева Н.В., Протасова И.Н., Перьянова О.В. и др. Бактерионосительство Streptococcus pneumoniae среди детей города Красноярска // Эпидемиол. и вакцинопроф. 2012. Т. 4, № 65. С. 73–77.Bakhareva N.V., Protasova I.N., Peryanova O.V. et al. Bakterionositel'stvo Streptococcus pneumoniae sredi detei goroda Krasnoyarska [Hosting Streptococcus pneumoniae among children in the city of Krasnoyarsk]. Epidemiologiya i vakcinoprofilaktika – Epidemiology and Vaccination, 2012, vol. 4, no. 65, pp. 73–77.Andrade A.L.S., Franco C.M., Lamaro-Cardoso J. et al. Non-typeable Streptococcus pneumoniae carriage isolates genetically similar to invasive and carriage isolates expressing capsular type 14 in Brazilian infants // J. of Infect. 2010. V. 61. P. 314–322. doi: 10.1016/j.jinf.2010.07.003.Andrade A.L.S., Franco C.M., Lamaro-Cardoso J. et al. Non-typeable Streptococcus pneumoniae carriage isolates genetically similar to invasive and carriage isolates expressing capsular type 14 in Brazilian infants. J. of Infect., 2010, vol. 61, pp. 314–322. doi: 10.1016/j.jinf.2010.07.003.Verstrheim D.F., Høiby E.A., Aaberge I.S., Caugant D.A. Phenotypic and genotypic characterization of Streptococcus pneumoniae strains colonizing children attending day-care centers in Norway // J. Clin. Microbiol. 2008. V. 46. P. 2508–2518. doi: 10.1128/CVI.00435-09.Verstrheim D.F., Høiby E.A., Aaberge I.S., Caugant D.A. Phe-notypic and genotypic characterization of Streptococcus pneumoniae strains colonizing children attending day-care centers in Norway. J. Clin. Microbiol., 2008, vol. 46, pp. 2508–2518. doi: 10.1128/CVI.00435-09.Johnson H.L., Deloria-Knoll M., Levine O.S. et al. Systematic evaluation of serotypes causing invasive pneumococcal disease among children under five: the pneumococcal global serotype project // PLoS Medicine. 2010. V. 7, № 10. e1000348. doi: 10.1371/journal.pmed.1000348.Johnson H.L., Deloria-Knoll M., Levine O.S. et al. Systematic evaluation of serotypes causing invasive pneumococcal disease among children under five: the pneumococcal global serotype project. PLoS Medicine, 2010, vol. 7, no. 10. e1000348. doi: 10.1371/journal.pmed.1000348.Reinert R.R. The antimicrobial resistance profile of Streptococcus pneumoniae // Clin. Microbiol. Infect. 2009. V. 15 (Suppl 3). P. 7–11.Reinert R.R. The antimicrobial resistance profile of Streptococcus pneumoniae. Clin. Microbiol. Infect., 2009, vol. 15 (Suppl 3), pp. 7–11.Савинова Т.А., Филимонова О.Ю., Грудинина С.А., Сидоренко С.В. Генетическое разнообразие пенициллино-устойчивых Streptococcus pneumoniae // Журн. инфект. 2009. Т. 1, № 4. С. 66–71.Savinova T.A., Filimonova O.Yu., Grudinina S.A., Sido-renko S.V. Geneticheskoe raznoobrazie penicillinoustoichivyh Streptococcus pneumoniae [Genetic diversity of penicillin re-sistant Streptococcus pneumoniae]. Zhurn. Infect, 2009, vol. 1, no. 4, pp. 66–71.Reinert R.R., Filimonova O.Y., Al-Lahham A. et al. Mechanisms of macrolide resistance among Streptococcus pneumoniae isolates from Russia // Antimicrob. Agents Chemother. 2008. V. 52, № 6. Р. 2260–2262.Reinert R.R., Filimonova O.Y., Al-Lahham A. et al. Mechanisms of macrolide resistance among Streptococcus pneumoniae isolates from Russia. Antimicrob. Agents Chemother., 2008, vol. 52, no. 6, pp. 2260–2262.Кречикова О.И., Козлов Р.С., Богданович Т.М. и др. Выделение, идентификация и определение чувствительности к антибиотикам Streptococcus pneumoniae (методические рекомендации) // Клин. микробиол. антимикроб. химио-тер. 2000. Т. 2, № 1. С. 88–98.Krechikova O.I., Kozlov R.S., Bogdanovich T.M. et al. Vydelenie, identifikaciya i opredelenie chuvstvitel'nosti k antibiotikam Streptococcus pneumoniae [Isolation, identification and definition of sensitivity to antibiotics of Streptococcus pneumoniae]. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya himioterapiya – Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 2000, vol. 2, no. 1, pp. 88–98.CDC Streptococcus Laboratory. URL: http://www.cdc.gov/nci-dod/biotech/strep/protocols.htm (дата обращения: 10.03.2014).CDC Streptococcus Laboratory. URL: http://www.cdc.gov /ncidod/biotech/strep/protocols.htm (accessed 10.03.2014)Савинова Т.А. Генетическое разнообразие и молекулярные основы резистентности Streptococcus pneumoniae к β-лактамным антибиотикам: автореф. дис. … кандидат биологических наук. М., 2011.Savinova T.A. Geneticheskoe raznoobrazie i molekulyarnye osnovy rezistentnosti Streptococcus pneumoniae k β-laktamnym antibiotikam [Genetic diversity and molecular basis of resistance of Streptococcus pneumoniae to β-lactam antibiotics]. Author. Dis. cand. biol. Sci. Moscow, 2011.Шварц Выборочный метод. Руководство по применению статистических методов оценивания / пер. с нем. Я.Ш. Паппэ; под ред. И.Г. Венецкого и В.М. Ивановой. М.: Статистика, 1978. 213 с.Shvarc G. Vyborochnyj metod. Rukovodstvo po primeneniju statisticheskih metodov ocenivanija. Per. s nem. Ja.Sh. Pappe. Pod red. I.G. Veneckogo i V.M. Ivanovoi. Moscow, Statistika Publ., 1978. 213 p.)Козлов Р.С., Чагарян А.Н., Козлова Л.В., Муравьев А.А. Се-рологическая характеристика и чувствительность к антибиотикам пневмококков, выделенных у детей в возрасте до 5 лет в отдельных регионах Российской Федерации // Клин. микробиол. антимикроб. химиотер. 2011. Т. 13, № 2. С. 177–187.Kozlov R.S., Chagarjan A.N., Kozlova L.V., Murav'ev A.A. Serologicheskaja harakteristika i chuvstvitel'nost' k antibiotikam pnevmokokkov, vydelennyh u detej v vozraste do 5 let v otdel'nyh regionah Rossijskoj Federacii [Serological characteri-zation and antibiotic sensitivity of pneumococci isolated from children under the age of 5 years in some regions of the Russian Federation]. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya himioterapiya – Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemo-therapy, 2011, vol. 13, no 2, pp. 177–187.Рудакова А.В., Баранов А.А., Лобзин Ю.В. и др. Фарма-коэкономические аспекты вакцинации детей 13-валентной пневмококковой конъюгированной вакциной в Рос-сийской Федерации // Вопр. соврем. педиатрии. 2014. Т. 13, № 1. С. 35–41.Rudakova A.V., Baranov A.A., Lobzin Ju.V. i dr. Farmakojekonomicheskie aspekty vakcinacii detej 13-valentnoj pnevmokokkovoj konjugirovannoj vakcinoj v Rossijskoj Federacii [Pharmacoeconomic aspects of vaccination of children 13-valent pneumococcal conjugate vaccine in the Russian Fed-eration]. Voprosy sovremennoi pediatrii – Current Pediatrics, 2014, vol. 13, no. 1, pp. 35–41.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.