ssmuБюллетень сибирской медициныBulletin of Siberian Medicine1682-03631819-3684Siberian State Medical University, the Ministry of Healthcare of the Russian Federation10.20538/1682-0363-2006--24-35ssmu-3193Research ArticleВИРУСНЫЕ ИНФЕКЦИИVIRAL INFECTIONSГенетические различия восточноевропейской и азиатской популяций вируса клещевого энцефалита сибирского подтипаGenetic diversity of East European and Asian strains of tick-borne encephalitis virus belonging to Siberian genotypeКараньЛ. С.KaranL. S.noemail@neicon.ruПогодинаВ. В.PogodinaV. V.noemail@neicon.ruФроловаТ. В.FrolovaT. V.noemail@neicon.ruПлатоновА. Е.PlatonovA. Ye.noemail@neicon.ruЦентральный НИИ эпидемиологии РоспотребнадзораRussian FederationИнститут полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова РАМНRussian Federation20063012200650Приложение 12435Copyright © Карань Л.С., Погодина В.В., Фролова Т.В., Платонов А.Е., 20062006Карань Л.С., Погодина В.В., Фролова Т.В., Платонов А.Е.Karan L.S., Pogodina V.V., Frolova T.V., Platonov A.Y.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://bulletin.ssmu.ru/jour/article/view/3193

Исследованы 40 штаммов вируса клещевого энцефалита, относящиеся к сибирскому генотипу. Анализ нуклеотидной последовательности участка гена Е длиной 211 н.п. показал формирование двух кластеров. Один из них объединяет штам- мы восточноевропейского топоварианта (ВЕ), другой — азиатского (А). В 234-м аминокислотном положении гена Е у 17 из 20 исследованных штаммов ВЕ топоварианта находится гистидин (H), у остальных трех — глутамин (Q) или тирозин (Y). Среди 20 штаммов азиатского топоварианта у 13 в позиции 234 присутствует гистидин (H), у 7 — глутамин (Q).

We have studied 40 strains of tick-borne encephalitis virus attributed to Siberian genotype. The fragment of E gene (211 nt) has been sequenced for all strains. Futher analysis has evidenced the formation of two clusters. One of them includes the strains of East European (EE) origin, the other comprises the strains of Asian origin (A). 17 of 20 East European strains have histidin (H) in amino acid position 234 of gene E, the remaining 3 have either glutamine (Q) or tyrosine (Y). 13 Asian strains have histidine and 7 Asian strains have glutamine in amino acid position 234.

вирус клещевого энцефалитасибирский генотипвосточноевропейская и азиатская популяциисе- квенированиеtick-borne encephalitis virusSiberian genotypeEast European and Asian populationssequencingReferencesВотяков В.И., Злобин В.И., Мешаева Н.П. Клещевые энцефалиты Евразии. Новосибирск: Наука, 2002. 438 с.Вотяков В.И., Злобин В.И., Мешаева Н.П. Клещевые энцефалиты Евразии. Новосибирск: Наука, 2002. 438 с.Злобин В.И., Беликов С.И., Джиоев Ю.П. и др. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита. Иркутск: РИО ВСНЦ СО РАМН, 2003. 272 с.Злобин В.И., Беликов С.И., Джиоев Ю.П. и др. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита. Иркутск: РИО ВСНЦ СО РАМН, 2003. 272 с.Иерусалимский А.П. Клещевой энцефалит. Новосибирск: Гос. мед. академия МЗ РФ, 2001. 360 с.Иерусалимский А.П. Клещевой энцефалит. Новосибирск: Гос. мед. академия МЗ РФ, 2001. 360 с.Коренберг Э.И., Ковалевский Ю.В. Районирование ареала вируса клещевого энцефалита. М., 1981. 148 с.Коренберг Э.И., Ковалевский Ю.В. Районирование ареала вируса клещевого энцефалита. М., 1981. 148 с.Краминская Н.Н., Живоляпина Р.Р., Мейерова Р.А. Опыт вирусологического изучения гиперкинетических форм клещевого энцефалита с прогредиентным течением // Актуальные проблемы вирусологии и профилактики вирусных заболеваний. М., 1972. С. 224—225.Краминская Н.Н., Живоляпина Р.Р., Мейерова Р.А. Опыт вирусологического изучения гиперкинетических форм клещевого энцефалита с прогредиентным течением // Актуальные проблемы вирусологии и профилактики вирусных заболеваний. М., 1972. С. 224—225.Левкович Е.Н. Вирусологические и иммунологические исследования вспышки энцефалита в Ленинградской области // Весенне-летний энцефалит в Ленинградской области. Л., 1945. С. 82—93.Левкович Е.Н. Вирусологические и иммунологические исследования вспышки энцефалита в Ленинградской области // Весенне-летний энцефалит в Ленинградской области. Л., 1945. С. 82—93.Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Карань Л.С. и др. Сибирский и дальневосточный подтипы вируса клещевого энцефалита в европейских и азиатских регионах России: генетическая и антигенная характеристика штаммов // Вопр. вирусологии. 2004. № 4. С. 20—25.Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Карань Л.С. и др. Сибирский и дальневосточный подтипы вируса клещевого энцефалита в европейских и азиатских регионах России: генетическая и антигенная характеристика штаммов // Вопр. вирусологии. 2004. № 4. С. 20—25.Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Карань Л.С. и др. Сравнительный анализ вирулентности сибирского и дальневосточного подтипов вируса клещевого энцефалита на основе экспериментальных и клинических данных // Вопр. вирусологии. 2004. № 6. С. 24—30.Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Карань Л.С. и др. Сравнительный анализ вирулентности сибирского и дальневосточного подтипов вируса клещевого энцефалита на основе экспериментальных и клинических данных // Вопр. вирусологии. 2004. № 6. С. 24—30.Gritsun T.S., Venugopal K., Zanotto M. et al. Complete sequence of two tick-borne flaviviruses isolated from Siberia and the UK: analysis and significance of the 5’ and 3’ UTRs // Virus. Res. 1997. Vol. 49. P. 27—30.Gritsun T.S., Venugopal K., Zanotto M. et al. Complete sequence of two tick-borne flaviviruses isolated from Siberia and the UK: analysis and significance of the 5’ and 3’ UTRs // Virus. Res. 1997. Vol. 49. P. 27—30.Gritsun T.S., Frolova T.V., Zhankov A.I. et al. Characterization of a Siberian virus isolated from a patient with progressive chronic tick-borne encephalitis // J. Virol. 2003. Vol. 7. P. 25—36.Gritsun T.S., Frolova T.V., Zhankov A.I. et al. Characterization of a Siberian virus isolated from a patient with progressive chronic tick-borne encephalitis // J. Virol. 2003. Vol. 7. P. 25—36.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.