ssmuБюллетень сибирской медициныBulletin of Siberian Medicine1682-03631819-3684Siberian State Medical University, the Ministry of Healthcare of the Russian Federation10.20538/1682-0363-2020-4-80-85ssmu-4153Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL PAPERSМетилирование промотора гена ABCA1 и внезапная сердечная смертьABCA1 gene promoter methylation and sudden cardiac deathhttps://orcid.org/0000-0002-9460-6294ИвановаА. А.IvanovaA. A.

канд. мед. наук, ст. науч. сотрудник, лаборатория молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний

Россия, 630089, г. Новосибирск, ул. Б. Богаткова, 175/1

175/1, B. Bogatkova Str., Novosibirsk, 630089, Russian Federation

ivanova_a_a@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-1547-624XГуражеваА. А.GurazhevaA. A.

мл. науч. сотрудник, лаборатория молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний

Россия, 630089, г. Новосибирск, ул. Б. Богаткова, 175/1

175/1, B. Bogatkova Str., Novosibirsk, 630089, Russian Federation

https://orcid.org/0000-0002-2924-9147АкиншинаЕ. И.AkinshinaE. I.

мл. науч. сотрудник, лаборатория молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний

Россия, 630089, г. Новосибирск, ул. Б. Богаткова, 175/1

175/1, B. Bogatkova Str., Novosibirsk, 630089, Russian Federation

https://orcid.org/0000-0002-2472-181XМаксимоваС. В.MaksimovaS. V.

студентка, 3-й курс, педиатрический факультет

Россия, 630091, г. Новосибирск, Красный проспект, 52

52, Krasny Av., Novosibirsk, 630091, Russian Federation

https://orcid.org/0000-0001-6539-0466МалютинаС. К.MalyutinaS. K.

д-р мед. наук, профессор, зав. лабораторией этиопатогенеза и клиники внутреннихзаболеваний

Россия, 630089, г. Новосибирск, ул. Б. Богаткова, 175/1

175/1, B. Bogatkova Str., Novosibirsk, 630089, Russian Federation

https://orcid.org/0000-0002-6312-5543НовоселовВ. П.NovoselovV. P.

д-р мед. наук, профессор, начальник

Россия, 630087, г. Новосибирск, ул. Немировича-Данченко, 134

134, Nemirovicha-Danchenko Str., Novosibirsk, 630087, Russian Federation

https://orcid.org/0000-0003-2799-0756РодинаИ. А.RodinaI. A.

канд. мед. наук, врач судебно-медицинский эксперт

Россия, 630087, г. Новосибирск, ул. Немировича-Данченко, 134

134, Nemirovicha-Danchenko Str., Novosibirsk, 630087, Russian Federation

https://orcid.org/0000-0002-2960-193XХамовичО. В.KhamovichO. V.

канд. мед. наук, врач судебно-медицинский эксперт

Россия, 630087, г. Новосибирск, ул. Немировича-Данченко, 134

134, Nemirovicha-Danchenko Str., Novosibirsk, 630087, Russian Federation

https://orcid.org/0000-0002-7165-4496МаксимовВ. Н.MaksimovV. N.

д-р мед. наук, доцент, зав. лабораторией молекулярно-генетических исследований терапевтических заболеваний

Россия, 630089, г. Новосибирск, ул. Б. Богаткова, 175/1

175/1, B. Bogatkova Str., Novosibirsk, 630089, Russian Federation

Научно-исследовательский институт терапии и профилактической медицины (НИИТПМ) – филиал Федерального исследовательского центра «Институт цитологии и генетики» Сибирского отделения Российской академии наук (ФИЦ ИЦиГ СО РАН)РоссияInstitution of Internal and Preventive Medicine, Branch of the Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of SciencesRussian FederationНовосибирский государственный медицинский университет (НГМУ)РоссияNovosibirsk State Medical UniversityRussian FederationНовосибирское областное клиническое бюро судебно-медицинской экспертизы (НОКБСМЭ)РоссияNovosibirsk Regional Office of Forensic Medical ExaminationRussian Federation2020070120211948085Copyright © Иванова А.А., Гуражева А.А., Акиншина Е.И., Максимова С.В., Малютина С.К., Новоселов В.П., Родина И.А., Хамович О.В., Максимов В.Н., 20212021Иванова А.А., Гуражева А.А., Акиншина Е.И., Максимова С.В., Малютина С.К., Новоселов В.П., Родина И.А., Хамович О.В., Максимов В.Н.Ivanova A.A., Gurazheva A.A., Akinshina E.I., Maksimova S.V., Malyutina S.K., Novoselov V.P., Rodina I.A., Khamovich O.V., Maksimov V.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://bulletin.ssmu.ru/jour/article/view/4153Цель

Цель. Исследование ассоциации метилирования промотора гена ABCA1 с внезапной сердечной смертью (ВСС).

Материалы и методы

Материалы и методы. Дизайн исследования построен по принципу «случай – контроль». Группа ВСС включала 150 мужчин (средний возраст (46,7 ± 9,2) года), умерших внезапной сердечной смертью согласно данным судебно-медицинской экспертизы (основные патологоанатомические диагнозы – острая недостаточность  кровообращения, острая коронарная недостаточность). Контрольная группа включает  150 мужчин (средний возраст (42,6 ± 1,2) года), умерших внезапно, но не вследствие сердечно-сосудистой патологии. ДНК выделена методом фенол-хлороформной экстракции из ткани миокарда. Оценка статуса метилирования промотора гена ABCA1 проведена методом метил-специфической полимеразной цепной реакции. Полученные результаты статистически обработаны в SPSS 16.0 с применением критерия Пирсона, критерия Фишера с поправкой Йетса на непрерывность. В качестве уровня значимости использован р < 0,05.

Результаты

Результаты. При сравнении групп выявлены статистически значимые различия по статусу метилирования промотора гена ABCA1 между группами (р = 0,015). В группе  ВСС доля лиц, у которых промотор гена ABCA1 метилирован, статистически значимо больше по сравнению с контрольной группой (p = 0,020; ОШ = 5,86; 95%-й доверительный интервал (1,28–26,89)).

Заключение

Заключение. Метилирование промотора гена ABCA1 ассоциировано с внезапной сердечной смертью. 

Aim

Aim. A study of the association of the methylation of the promoter of the ABCA1 gene with sudden cardiac death(SCD).

Materials and methods

Materials and methods. The study design is based on the case-control principle. The SCD group included 150 men (mean age (46.7 ± 9.2) years) who died of sudden cardiac death according to forensic medical examination data (the main pathological diagnoses are acute circulatory failure, acute coronary insufficiency). The control group included 150 men (mean age (42.6 ± 1.2) years) who died suddenly, but not due to cardiovascular pathology. DNA was isolated by phenol-chloroform extraction from myocardial tissue. The methylation status of the ABCA1 gene promoter was assessed by methyl-specific polymerase chain reaction. The results obtained were statistically processed in SPSS 16.0 using Pearson’s test and Fisher’s test with Yates’ correction for continuity. P < 0.05 was used as a level of significance.

Results

Results. Comparing the groups revealed statistically significant differences in the methylation status of the gene promoter (p = 0.015). In the SCD group, the proportion of individuals whose ABCA1 gene promoter is methylated is statistically significantly higher compared to the control group (p = 0.020; OR = 5.86; 95% CI (1.28–26.89)).

Conclusion

Conclusion. Methylation of the promoter of the ABCA1 gene is associated with sudden cardiac death.

внезапная сердечная смертьметилированиеABCA1промоторsudden cardiac deathmethylationABCA1promoterИсследование выполнено при финансовой поддержке РФФИ и Правительства Новосибирской области (проект № 19-415-543001).The study was carried out with the financial support of the Russian Foundation for Basic Research and the Government of the Novosibirsk Region (project No. 19-415-543001).ReferencesPriori S.G., Blomström-Lundqvist C., Mazzanti A., Blom N., Borggrefe M., Camm J., Elliott P.M., Fitzsimons D., Hatala R., Hindricks G., Kirchhof P., Kjeldsen K., Kuck K.H., Hernandez-Madrid A., Nikolaou N., Norekvål T.M., Spaulding C., van Veldhuisen D.J. The task force for the anagement of patients with ventricular arrhythmias and the prevention of sudden cardiac death of the European Society of Cardiology (ESC). G. Ital. Cardiol. 2016; 17 (2): 108–170. DOI: 10.1714/2174.23496.Priori S.G., Blomström-Lundqvist C., Mazzanti A., Blom N., Borggrefe M., Camm J., Elliott P.M., Fitzsimons D., Hatala R., Hindricks G., Kirchhof P., Kjeldsen K., Kuck K.H., Hernandez-Madrid A., Nikolaou N., Norekvål T.M., Spaulding C., van Veldhuisen D.J. The task force for the anagement of patients with ventricular arrhythmias and the prevention of sudden cardiac death of the European Society of Cardiology (ESC). G. Ital. Cardiol. 2016; 17 (2): 108–170. DOI: 10.1714/2174.23496.Федеральная служба государственной статистики. Информационно-аналитические материалы. Естественное движение населения. URL: https://gks.ru/compendium/document/13269.Федеральная служба государственной статистики. Информационно-аналитические материалы. Естественное движение населения. URL: https://gks.ru/compendium/document/13269.Ghaznavi H., Mahmoodi K., Soltanpour M.S. A preliminary study of the association between the ABCA1 gene promoter DNA methylation and coronary artery disease risk. Mol. Biol. Res. Commun. 2018; 7 (2): 59–65. DOI: 10.22099/mbrc.2018.28910.1312.Ghaznavi H., Mahmoodi K., Soltanpour M.S. A preliminary study of the association between the ABCA1 gene promoter DNA methylation and coronary artery disease risk. Mol. Biol. Res. Commun. 2018; 7 (2): 59–65. DOI: 10.22099/mbrc.2018.28910.1312.Nazarenko M.S., Markov A.V., Lebedev I.N., Freidin M.B., Sleptcov A.A., Koroleva I.A., Frolov A.V., Popov V.A., Barbarash O.L., Puzyrev V.P. A comparison of genome- wide DNA methylation patterns between different vascular tissues from patients with coronary heart disease. PLoS One. 2015; 10 (4): e0122601. DOI: 10.1371/journal.pone.0122601.Nazarenko M.S., Markov A.V., Lebedev I.N., Freidin M.B., Sleptcov A.A., Koroleva I.A., Frolov A.V., Popov V.A., Barbarash O.L., Puzyrev V.P. A comparison of genome- wide DNA methylation patterns between different vascular tissues from patients with coronary heart disease. PLoS One. 2015; 10 (4): e0122601. DOI: 10.1371/journal.pone.0122601.Wang X., Liu A.H., Jia Z.W., Pu K., Chen K.Y., Guo H. Genome-wide DNA methylation patterns in coronary heart disease. Herz. 2018; 43 (7): 656–662. DOI: 10.1007/s00059-017-4616-8.Wang X., Liu A.H., Jia Z.W., Pu K., Chen K.Y., Guo H. Genome-wide DNA methylation patterns in coronary heart disease. Herz. 2018; 43 (7): 656–662. DOI: 10.1007/s00059-017-4616-8.Banerjee S., Ponde C.K., Rajani R.M., Ashavaid T.F. Differential methylation pattern in patients with coronary artery disease: pilot study. Mol. Biol. Rep. 2019; 46 (1): 541–550. DOI: 10.1007/s11033-018-4507-y.Banerjee S., Ponde C.K., Rajani R.M., Ashavaid T.F. Differential methylation pattern in patients with coronary artery disease: pilot study. Mol. Biol. Rep. 2019; 46 (1): 541–550. DOI: 10.1007/s11033-018-4507-y.Guay S.P., Légaré C., Brisson D., Mathieu P., Bossé Y., Gaudet D., Bouchard L. Epigenetic and genetic variations at the TNNT1 gene locus are associated with HDL-C levels and coronary artery disease. Epigenomics. 2016; 8 (3): 359–371. DOI: 10.2217/epi.15.120.Guay S.P., Légaré C., Brisson D., Mathieu P., Bossé Y., Gaudet D., Bouchard L. Epigenetic and genetic variations at the TNNT1 gene locus are associated with HDL-C levels and coronary artery disease. Epigenomics. 2016; 8 (3): 359–371. DOI: 10.2217/epi.15.120.Infante T., Forte E., Schiano C., Punzo B., Cademartiri F., Cavaliere C., Salvatore M., Napoli C. Evidence of association of circulating epigenetic-sensitive biomarkers with suspected coronary heart disease evaluated by cardiac computed tomography. PLoS One. 2019; 14 (1): e0210909. DOI: 10.1371/journal.pone.0210909.Infante T., Forte E., Schiano C., Punzo B., Cademartiri F., Cavaliere C., Salvatore M., Napoli C. Evidence of association of circulating epigenetic-sensitive biomarkers with suspected coronary heart disease evaluated by cardiac computed tomography. PLoS One. 2019; 14 (1): e0210909. DOI: 10.1371/journal.pone.0210909.Ma S.C., Zhang H.P., Kong F.Q., Zhang H., Yang C., He Y.Y., Wang Y.H., Yang A.N., Tian J., Yang X.L., Zhang M.H., Xu H., Jiang Y.D., Yu Z. Integration of gene expression and DNA methylation profiles provides a molecular subtype for risk assessment in atherosclerosis. Mol. Med. Rep. 2016; 13 (6): 4791–4799. DOI: 10.3892/mmr.2016.5120.Ma S.C., Zhang H.P., Kong F.Q., Zhang H., Yang C., He Y.Y., Wang Y.H., Yang A.N., Tian J., Yang X.L., Zhang M.H., Xu H., Jiang Y.D., Yu Z. Integration of gene expression and DNA methylation profiles provides a molecular subtype for risk assessment in atherosclerosis. Mol. Med. Rep. 2016; 13 (6): 4791–4799. DOI: 10.3892/mmr.2016.5120.Fujii R., Yamada H., Munetsuna E., Yamazaki M., Mizuno G., Tsuboi Y., Ohashi K., Ishikawa H., Ando Y., Hagiwara C., Maeda K., Hashimoto S., Hamajima N., Suzuki K. Dietary vegetable intake is inversely associated with ATP-binding cassette protein A1 (ABCA1) DNA methylation levels among Japanese women. Nutrition. 2019; 65: 1–5. DOI: 10.1016/j.nut.2019.02.010.Fujii R., Yamada H., Munetsuna E., Yamazaki M., Mizuno G., Tsuboi Y., Ohashi K., Ishikawa H., Ando Y., Hagiwara C., Maeda K., Hashimoto S., Hamajima N., Suzuki K. Dietary vegetable intake is inversely associated with ATP-binding cassette protein A1 (ABCA1) DNA methylation levels among Japanese women. Nutrition. 2019; 65: 1–5. DOI: 10.1016/j.nut.2019.02.010.Fujii R., Yamada H., Munetsuna E., Yamazaki M., Ando Y., Mizuno G., Tsuboi Y., Ohashi K., Ishikawa H., Hagiwara C., Maeda K., Hashimoto S., Suzuki K. Associations between dietary vitamin intake, ABCA1 gene promoter DNA methylation, and lipid profiles in a Japanese population. Am. J. Clin. Nutr. 2019; 110 (5): 1213–1219. DOI: 10.1093/ajcn/nqz181.Fujii R., Yamada H., Munetsuna E., Yamazaki M., Ando Y., Mizuno G., Tsuboi Y., Ohashi K., Ishikawa H., Hagiwara C., Maeda K., Hashimoto S., Suzuki K. Associations between dietary vitamin intake, ABCA1 gene promoter DNA methylation, and lipid profiles in a Japanese population. Am. J. Clin. Nutr. 2019; 110 (5): 1213–1219. DOI: 10.1093/ajcn/nqz181.Lu Y., Liu Y., Li Y., Zhang H., Yu M., Kanu J.S., Qiao Y., Tang Y., Zhen Q., Cheng Y. Association of ATP-binding cassette transporter A1 gene polymorphisms with plasma lipid variability and coronary heart disease risk. Int. J. Clin. Exp. Pathol. 2015; 8 (10): 13441–13449.Lu Y., Liu Y., Li Y., Zhang H., Yu M., Kanu J.S., Qiao Y., Tang Y., Zhen Q., Cheng Y. Association of ATP-binding cassette transporter A1 gene polymorphisms with plasma lipid variability and coronary heart disease risk. Int. J. Clin. Exp. Pathol. 2015; 8 (10): 13441–13449.Wang F., Ji Y., Chen X., Song Y., Huang S., Zhou C., Huang C., Chen Z., Zhang L., Ge J. ABCA1 variants rs2230806 (R219K), rs4149313 (M8831I), and rs9282541 (R230C) are associated with susceptibility to coronary heart disease. J. Clin. Lab. Anal. 2019; 33 (6): e22896. DOI: 10.1002/jcla.22896.Wang F., Ji Y., Chen X., Song Y., Huang S., Zhou C., Huang C., Chen Z., Zhang L., Ge J. ABCA1 variants rs2230806 (R219K), rs4149313 (M8831I), and rs9282541 (R230C) are associated with susceptibility to coronary heart disease. J. Clin. Lab. Anal. 2019; 33 (6): e22896. DOI: 10.1002/jcla.22896.Smirnov G.P., Malyshev P.P., Rozhkova T.A., Zubareva M.Y., Shuvalova Y.A., Rebrikov D.V., Titov V.N. The effect of ABCA1 rs2230806 common gene variant on plasma lipid levels in patients with dyslipidemia. Klin. Lab. Diagn. 2018; 63 (7): 410–413. DOI: 10.18821/0869-2084 -2018-63-7-410-413.Smirnov G.P., Malyshev P.P., Rozhkova T.A., Zubareva M.Y., Shuvalova Y.A., Rebrikov D.V., Titov V.N. The effect of ABCA1 rs2230806 common gene variant on plasma lipid levels in patients with dyslipidemia. Klin. Lab. Diagn. 2018; 63 (7): 410–413. DOI: 10.18821/0869-2084 -2018-63-7-410-413.Ma Y., Follis J.L., Smith C.E., Tanaka T., Manichaikul A.W., Chu A.Y., Samieri C., Zhou X., Guan W., Wang L., Biggs M.L., Chen Y.D., Hernandez D.G., Borecki I., Chasman D., Rich S.S., Ferrucci L., Irvin M.R., Aslibekyan S., Zhi D., Tiwari H.K., Claas S.A., Sha J., Kabagambe E.K., Lai C.Q., Parnell L.D., Lee Y.C., Amouyel P., Lambert J.C., Psaty B.M., King I.B., Mozaffarian D., McKnight B., Bandinelli S., Tsai M.Y., Ridker P.M., Ding J., Mstat K.L., Liu Y., Sotoodehnia N., Barberger-Gateau P., Steffen L.M., Siscovick D.S., Absher D., Arnett D.K., Ordovás J.M., Lemaitre RN interaction of methylation-related genetic variants with circulating fatty acids on plasma lipids: a meta-analysis of 7 studies and methylation analysis of 3 studies in the cohorts for heart and aging research in genomic pidemiology consortium. Am. J. Clin. Nutr. 2016; 103 (2): 567–578. DOI: 10.3945/ajcn.115.112987.Ma Y., Follis J.L., Smith C.E., Tanaka T., Manichaikul A.W., Chu A.Y., Samieri C., Zhou X., Guan W., Wang L., Biggs M.L., Chen Y.D., Hernandez D.G., Borecki I., Chasman D., Rich S.S., Ferrucci L., Irvin M.R., Aslibekyan S., Zhi D., Tiwari H.K., Claas S.A., Sha J., Kabagambe E.K., Lai C.Q., Parnell L.D., Lee Y.C., Amouyel P., Lambert J.C., Psaty B.M., King I.B., Mozaffarian D., McKnight B., Bandinelli S., Tsai M.Y., Ridker P.M., Ding J., Mstat K.L., Liu Y., Sotoodehnia N., Barberger-Gateau P., Steffen L.M., Siscovick D.S., Absher D., Arnett D.K., Ordovás J.M., Lemaitre RN interaction of methylation-related genetic variants with circulating fatty acids on plasma lipids: a meta-analysis of 7 studies and methylation analysis of 3 studies in the cohorts for heart and aging research in genomic pidemiology consortium. Am. J. Clin. Nutr. 2016; 103 (2): 567–578. DOI: 10.3945/ajcn.115.112987.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.