ssmuБюллетень сибирской медициныBulletin of Siberian Medicine1682-03631819-3684Siberian State Medical University, the Ministry of Healthcare of the Russian Federation10.20538/1682-0363-2014-3-40-45ssmu-47Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL PAPERSМУЛЬТИЛОКУСНОЕ СИКВЕНСТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE, ВЫДЕЛЕННЫХ У ПАЦИЕНТОВ ПОЖИЛОГО ВОЗРАСТА С ВНЕБОЛЬНИЧНЫМИ ПНЕВМОНИЯМИMULTILOCI SEQUESTERANT STRAINS OF STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE ISOLATED FROM ELDERLY PATIENTS WITH COMMUNITY ACQUIRED PNEUMONIAМартыноваА. В.MartynovaA. V.

Доктор медицинских наук, кафедра эпидемиологии и военной эпидемиологии, Тихоокеанский ГМУ, кафедра биохимии, микробиологии и биотехнологии, Школа естественных наук, Дальневосточный федеральный университет

clinmicro@yandex.ruБалабановаЛ. А.BalabanovaL. A.

Кандидат биологических наук, лаборатория морской биохимии

clinmicro@yandex.ruЧулаковаО. А.ChulakovaO. A.

Аспирант кафедры эпидемиологии и военной эпидемиологии

clinmicro@yandex.ruТихоокеанский государственный медицинский университет, Владивосток; Дальневосточный федеральный университет, ВладивостокРоссияPacific State Medical University, Vladivostok; Far Eastern Federal University, VladivostokRussian FederationТихоокеанский институт биоорганической химии имени Г.Б. Елякова, ВладивостокРоссияPacific Institute of Bioorganic Chemistry named after G.B. Yelyakov, VladivostokRussian FederationТихоокеанский государственный медицинский университет, ВладивостокРоссияPacific State Medical University, VladivostokRussian Federation2014280620141334045Copyright © Мартынова А.В., Балабанова Л.А., Чулакова О.А., 20142014Мартынова А.В., Балабанова Л.А., Чулакова О.А.Martynova A.V., Balabanova L.A., Chulakova O.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://bulletin.ssmu.ru/jour/article/view/47

Внебольничные пневмонии у лиц пожилого возраста являются значимой эпидемиологической проблемой для здравоохранения практически всех стран. Особенно актуальна проблема микробиологического мониторинга и эпидемиологического надзора за штаммами Streptococcuspneumoniae, как одного из убиквитарных возбудителей, вызывающих внебольничные пневмонии и другие инфекции дыхательных путей различной степени тяжести, что определяется их различной эпидемической значимостью.Мультилокусное сиквенстипирование – перспективный метод молекулярно-эпидемиологического мониторинга, позволяющего идентифицировать эпидемически опасные клоны S. pneumoniae. Целью исследования являлось проведение мультилокусного сиквенстипирования штаммов пневмококка, выделенных у пациентов с внебольничными пневмониями, бронхитами и у носителей пожилого возраста.Материал и методы. Было проведено исследование 14 штаммов, выделенных у пациентов с внебольничными пневмониями (из них 7 полирезистентных), 8 штаммов от пациентов с хронической обструктивной болезнью легких, 4 штамма от носителей. Мультилокусное сиквенстипирование было проведено согласно методике M.C. Enright и B.G. Spratt (1998).Результаты. Все штаммы, выделенные в трех популяциях, представляют собой родственные изоляты вида S. pneumoniae, большинство из которых (18 из 26) обладают уникальным генотипом, определяющим наличие одного сиквенстипа для каждого штамма. Из 14 штаммов, выделенных у лиц пожилого возраста с внебольничной пневмонией, 6 относились к профилю Taiwan19F-14. Среди штаммов, выделенных от носителей, превалировал штамм, идентичный штамму R6. Среди штаммов, выделенных от пациентов с хронической обструктивной болезнью, превалирования какого-либо генотипа не выявлено.Заключение. Мультилокусное сиквенстипирование позволяет идентифицировать новые генотипы и дать прогноз относительно появления эпидемически опасных штаммов с новыми свойствами.

Comuunity-acquired pneumonias in aged patients is the significant epidemiology problem for the public health of almost all the countries. Even more important the problem of microbiological monitoring and epidemiology surveillance for the S. pneumoniae strains as one of the ubiquitous pathogens causing as the community-acquired pneumonias as well the other infections of respiratory tract, what defines their different epidemiological meaning.Multilocus sequence typing is the perspective method of molecular epidemiological surveillance allowing to define the epidemiologically dangerous clones of the ubiquitous microorganisms as Streptococcus pneumomiae. The aim of our research was to conduct the multilocus sequence typing of pneumococci strains isolated in patients with community acquired pneumonias, bronchitis in aged patients.Materials and methods. There were taken 14 strains of S. pneumoniae, isolated in patients with community-acquired pneumonias (seven of them were multiresistant), eight strains were isolated from patients with the chronical onstructive lung diseases and four strains from carriers. Multilocus sequence typing was conduected according to method to M.C. Enright and B.G. Spratt (1998).Results. The strains, isolated in all populations were the related isolates of the species S. pneumoniae, the most of them had the unique genotype defining the sequence type for every strain. There were 6 strains of Taiwan 19F-14 genotype from 14 strains isolated in aged patients with community-acquired pneumonia. Among strains isolated from carriers there were prevailing the strai of R6 genotype.Conclusion. Multilocus sequence typing allows to identify the new genotypes and to prognose the appearing of epidemiologically dangerous strains with new peculiarities.

мультилокусное сиквенстипированиневмококковые пневмониивнебольничные пневмонииS. pneumoniaemultilocus sequence typinumococcal pneumoniaecommunity-acquired pneumoniaS. pneumoniaeReferencesБачинская Е.Н. Возбудители внебольничных пневмоний на пороге нового тысячелетия // Антибиотики и химиотерапия. 2000. № 45. С. 21–28.Bachinskaya Ye.N. Antibiotics and Chemotherapy, 2000, no. 45, pp. 21–28 (in Russian).Богданов М.Б., Черненькая Т.В. Микробиологическая оценка антибактериальных препаратов, используемых для эмпирической терапии внебольничных инфекций нижних дыхательных путей // Антибиотики и химиотерапия. 2000. № 10. С. 15–19.Bogdanov M.B., Chornenkaya T.V. Antibiotics and Chemotherapy, 2000, no. 10, pp. 15–19 (in Russian).Жильцов И.В., Семёнов В.М. Бета-лактамазная активность мокроты и ее влияние на эффективность антибактериальной терапии // Туберкулез и болезни легких. 2012. № 4. С. 18–26.Zhiltsov I.V., Semyonov V.M. Tuberculosis and Lung Disease, 2012, no. 4, pp. 18–26 (in Russian).Новиков Ю.К. Диагностика и лечение внебольничных пневмоний // РМЖ. 2001. № 1. С. 11–16.Novikov Yu.K. Russian Medical Journal, 2001, no. 1, pp. 11–16 (in Russian).Об унификации микробиологических (бактериологических) методов исследования, применяемых в клинико-диагностических лабораториях лечебно-профилактических учреждений: приказ МЗ СССР № 535 от 22 апреля 1985 г.About the unification of microbiological (bacteriological) research methods used in clinical-diagnostic laboratories of Medical Institutions: order of the Ministry of Healthcare of USSR, 22.04.1985, no. 535 (in Russian).Семенов В.М., Дмитраченко Т.И., Жильцов И.В. Микробиологические аспекты резистентности к антимикробным препаратам // Туберкулез и болезни легких. 2012. № 4. С. 18–26.Semyonov V.M., Dmitrachenko T.I., Zhiltsov I.V. Tuberculosis and Lung Disease, 2012, no. 4 (in Russian).Синопальников А.И., Страчунский Л.С. Новые рекомендации по ведению взрослых пациентов с внебольничной пневмонией // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2001. № 1. С. 18–21.Sinopalnikov A.I., Strachunsky L.S. Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy, 2001, no. 1, pp. 18–21 (in Russian).Enright M.C., Spratt B.G. A multilocus sequence typing scheme for Streptococcus pneumoniae identification of clones association with serious invasive disease // Microbiology. 1998. Р. 1445049–1445060.Enright M.C., Spratt B.G. A multilocus sequence typing scheme for Streptococcus pneumoniae identification of clones association with serious invasive disease. Microbiology, 1998, рр. 1445049–1445060.Streptococcus pneumoniae. Textbook in Serotyping, Virulence Factors and Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA) for Measuring Pneumococcal Antibodies. Statens Serum Institute, Copenhagen, Denmark, 2013. 34 p.Streptococcus pneumoniae. Textbook in Serotyping, Virulence Factors and Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA) for Measuring Pneumococcal Antibodies. Statens Serum Institute, Copenhagen, Denmark, 2013. 34 p.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.