ssmuБюллетень сибирской медициныBulletin of Siberian Medicine1682-03631819-3684Siberian State Medical University, the Ministry of Healthcare of the Russian Federation10.20538/1682-0363-2016-2-20-27ssmu-577Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL PAPERSМОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОЕ РАССЛЕДОВАНИЕ ВСПЫШКИ СЕРОЗНЫХ МЕНИНГИТОВ В НОВОСИБИРСКОЙ ОБЛАСТИMOLECULAR-EPIDEMIOLOGICAL INVESTIGATION OF THE OUTBREAK OF ASEPTIC MENINGITIS IN NOVOSIBIRSK REGIONДеминаА. В.DeminaA. V.

Демина Анна Владимировна – кандидат медицинских наук, врач-инфекционист, старшийнаучый сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии

Deminaanna@mail.ruТерновойВ. А.TernovoiV. A.

Терновой Владимир Александрович – кандидат биологических наук, заведующий лабораторией молекулярной эпидемиологии ООИ ГНЦ ВБ «Вектор»

КарташовМ. Ю.KartashovM. Yu.

Карташов Михаил Юрьевич – мл. научный сотрудник лаборатории молекулярной эпидемиологии ООИ ГНЦ ВБ «Вектор»

ЛоктевВ. Б.LoktevV. B.

Локтев Валерий Борисович – доктор биологических наук, профессор, заведующий отделом молекулярной вирусологии флавивирусов и вирусных гепатитов ГНЦ ВБ «Вектор»

Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор», НовосибирскРоссияState Research Center of Virology and Biotechnology “Vector”, NovosibirskRussian FederationГосударственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор», Новосибирск; Томский государственный университет, ТомскРоссияState Research Center of Virology and Biotechnology “Vector”, Novosibirsk; Tomsk State University, Tomsk, Russian FederationRussian FederationГосударственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор», Новосибирск; Новосибирский государственный университет, НовосибирскРоссияState Research Center of Virology and Biotechnology “Vector”, Novosibirsk; Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russian FederationRussian FederationГосударственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор», Новосибирск; Томский государственный университет, Томск; Новосибирский государственный университет, НовосибирскРоссияState Research Center of Virology and Biotechnology “Vector”, Novosibirsk; Tomsk State University, Tomsk, Russian Federation; Novosibirsk State University, Novosibirsk, Russian FederationRussian Federation2016020620161522027Copyright © Демина А.В., Терновой В.А., Карташов М.Ю., Локтев В.Б., 20162016Демина А.В., Терновой В.А., Карташов М.Ю., Локтев В.Б.Demina A.V., Ternovoi V.A., Kartashov M.Y., Loktev V.B.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://bulletin.ssmu.ru/jour/article/view/577

Целью настоящей работы явилось расследование вспышки серозных менингитов в Новосибирской области в 2008–2009 гг., а также изучение генетического разнообразия и молекулярно-эпидемиологиче- ской характеристики энтеровирусов человека, вызвавших случаи серозного менингита. Материал и методы. В настоящей работе исследованы образцы спинномозговой жидкости от 199 па- циентов с диагнозом «серозный менингит», основанным на клинической картине заболевания (головная боль, ригидность затылочных мышц, температура, тошнота, рвота) и подтвержденным лабораторными исследованиями спинномозговой жидкости (лимфоцитарный цитоз >10 кл/мкл). Все образцы иссле- дованы методом ПЦР на наличие РНК Enterovirus и Flavivirus, ДНК Myc. tuberculosis, Borrelia spp., Neisseria spp.

 В результате исследования проб отмечено отсутствие РНК Flavivirus, ДНК Myc. tuberculosis, Borrelia spp., Neisseria spp., однако в 73 образцах (в 37% случаев) была выявлена РНК энтеровирусов (ЭВ). Опре- деление нуклеотидных последовательностей ЭВ по регионам 5’UTR и VP1 выявило их принадлежность к следующим генотипам: наибольшая доля была представлена генотипом ECHO 30 (62 %); также встреча- лись Cox A2 (8%), Cox A4 (5%), Cox A14 (3%), Cox A16 (5%), Cox B5 (8%), ECHO 6 (3%), ECHO 9 (3%) и ECHO 25 (3%). В2008 г. большая часть выявленных у населения Новосибирской области изолятов ЭВ, вызывавших симптомы менингита, принадлежала к генотипу ECHO 30 (76%). В2009 г. клинических образцов, содержавших изоляты генотипа ECHO 30, обнаружено не было, однако наибольшая доля выявленных энтеровирусов относился к генотипу Cox A2 (33%) и Cox A4 (22%).

Таким образом, в2008 г. нами зафиксирована вспышка серозных менингитов, основным этиологическим фактором которых яв- лялся энтеровирус ECHO 30, а подъем заболеваемости в2009 г. связан с циркуляцией среди населения новых генотипов энтеровирусов. Исследованные штаммы были депонированы в международной базе GenBank под номерами KP258231-KP258235, HM559584.

The aim of this study was to investigate the outbreak of aseptic meningitis in theNovosibirskregion in 2008–2009. We studied genetic diversity and molecular-epidemiological characteristics of human enteroviruses that caused aseptic meningitis. Materials and metods. In the present study we investigated samples of cerebrospinal fluid from 199 patients with a diagnosis “aseptic meningitis”, based on the clinical characteristics of the disease (headache, stiff neck, fever, nausea, vomiting), and confirmed by laboratory tests of spinal fluid (lymphocyte cell count > 10 cells/ml).

meningitisenterovirus infectionsenterovirusesEchovirusCoxsackievirusEnterovirusReferencesKing A.M., Lefkowitz E., Adams M.J., Carstens E.B. Virus Taxonomy: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Elsevier. 2011. № 1. P. 1338.King A.M., Lefkowitz E., Adams M.J., Carstens E.B. Virus Taxonomy: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Elsevier. 2011. № 1. P. 1338.Ronellenfitsch S., Tabatabai J., Böttcher S. et al. First report of a Chinese strain of coxsackie B3virus infection in a newborn in Germany in 2011: a case report // Journal of Medical Case Reports. 2014. № 8. P. 164.Ronellenfitsch S., Tabatabai J., Böttcher S. et al. First report of a Chinese strain of Coxsackie B3 virus infection in a newborn in Germany in 2011: a case report // Journal of Medical Case Reports. 2014. № 8. P. 164.Tapparel C., Siegrist F., Petty T.J., Kaiser L. Picornavirus and enterovirus diversity with associated human diseases // Infection, Genetics and Evolution. V. 14. 2013. P. 282–293.Tapparel C., Siegrist F., Petty T.J., Kaiser L. Picornavirus and enterovirus diversity with associated human diseases // Infection, Genetics and Evolution. V. 14. 2013. P. 282–293.Демина А.В., Терновой В.А., Дарижапов Б.Б., Якубич Т.В., Семенцова А.О., Демина О.К., Протопопова Е.В., Локтев В.Б., Агафонов А.П., Нетесов С.В. Вспышка острой кишечной инфекции ýнтеровирусной ýтиологии в Сахалинской области в августе 2010 г. // Вестник РАМН. 2012. № 2. С. 64–68.Demina A.V., Ternovoi V.A., Darizhapov B.B., YAkubich T.V., Sementsova A.O., Demina O.K., Protopopova E.V., Loktev V.B., Agafonov A.P., Netesov S.V. Vspyshka ostroj kishechnoj infekcii ehnterovirusnoj ehtiologii v Sahalinskoj oblasti v avguste 2010 g. [Outbreak of acute intestinal infections of enterovirus etiology in the Sakhalin region in August 2010]. Vestnik RAMN, 2012, № 2. pp. 64–68 (in Russian).Голицына Л.Н., Фомина С.Г., Парфенова О.В., Калашникова Н.А., Новикова Н.А. Молекулярно-генетическая характеристика ýпидемически значимых ýнтеровирусов вида А // Медицинский альманах. 2013. Т. 26, № 2. С. 96–99.Golicyna L.N., Fomina S.G., Parfenova O.V., Kalashnikova N.A., Novikova N.A. Molekulyarno-geneticheskaya harakteristika ehpidemicheski znachimyh ehnterovirusov vida A [Molecular-genetic characterization of epidemically significant enterovirus type A]. Medicinskij al’manah, 2013, vol. 26. No 2, pp. 96–99 (in Russian).Демина А.В., Карташов М.Ю., Чаусов Е.В., Протопопова Е.В., Терновой В.А. Молекулярно-биологическое исследование серозных менингитов в Ростовена-Дону в 2013 г. // VI Ежегодный всероссийский конгресс по инфекционным болезням, 24–26 марта 2014 г. Москва. http://www.congress-infection.ru/archiv.htm.Demina A.V., Kartashov M.Yu., Chausov E.V., Protopopova E.V., Ternovoj V.A. Molekulyarno-biologicheskoe issledovanie seroznyh meningitov v Rostove-na-Donu v 2013 g. [Molecular-biological research of serous meningitis in Rostov-on-Don in 2013]. VI Ezhegodnyj Vserossijskij Kongress po infekcionnym boleznyam, 24–26 marta 2014 g., Moskva. http://www. congress-infection.ru/archiv.htm (in Russian).Петрова И.С., Шишов А.С., Базарова М.В., Русанова С.А., Бургасова О.А., Бланк И.А., Лева В.Г., Шуренкова Е.Н., Москалева Е.И. Особенности течения ýнтеровирусных инфекций с менингитом у взрослых в ýпидемическом сезоне 2013 года // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2014. Т. 18, № 3. С. 15–21.Petrova I.S., Shishov A.S., Bazarova M.V., Rusanova S.A., Burgasova O.A., Blank I.A., Leva V.G., Shurenkova E.N., Moskaleva E.I. Osobennosti techeniya ehnterovirusnyh infekcij s meningitom u vzroslyh v ehpidemicheskom sezone 2013 goda [Peculiarities of enterovirus infection in adults with meningitis in an epidemic season of 2013] Epidemiologiya i infekcionnye bolezni, 2014, vol. 18. No 3, pp. 15–21 (in Russian).Takeshima S., Neshige S., Himeno T., Hara N., Yoshimoto T., Takamatsu K., Takao S., Kuriyama M. Clinical, epidemiological, and etiological studies of aseptic meningitis in adults.// RinshoShinkeigaku. 2014. V. 54, № 10. P. 791–797.Takeshima S., Neshige S., Himeno T., Hara N., Yoshimoto T., Takamatsu K., Takao S., Kuriyama M. Clinical, epidemiological, and etiological studies of aseptic meningitis in adults // RinshoShinkeigaku. 2014. V. 54. № 10. P. 791–797.Mladenova Z., Buttinelli G., Dikova A., Stoyanova A., Troyancheva M., Komitova R., Stoycheva M., Pekova L., Parmakova K., Fiore L. Aseptic meningitis outbreak caused by echovirus 30 in two regions in Bulgaria, May-August 2012 // Epidemiol Infect. 2014. Oct. V. 142, № 10. P. 2159–2165. 1Mladenova Z., Buttinelli G., Dikova A., Stoyanova A., Troyancheva M., Komitova R., Stoycheva M., Pekova L., Parmakova K., Fiore L. Aseptic meningitis outbreak caused by echovirus 30 in two regions in Bulgaria, MayAugust 2012 // Epidemiol Infect. 2014. Oct. V. 142. № 10. P. 2159–2165.Nix W.A., Oberste M.S., Pallansch M.A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens // J. Clin. Microbiol. 2006. V. 44. P. 2698–2704.Nix W.A., Oberste M.S., Pallansch M.A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens // J. Clin. Microbiol. 2006. V. 44. P. 2698–2704.Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., and Kumar S. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods // Molecular Biology and Evolution. 2011. № 28. P. 2731–2739.Tamura K., Peterson D., Peterson N., Stecher G., Nei M., and Kumar S. MEGA5: Molecular Evolutionary Genetics Analysis using Maximum Likelihood, Evolutionary Distance, and Maximum Parsimony Methods // Molecular Biology and Evolution. 2011. № 28. P. 2731– 2739.Ortner B., Huang C.-W., Schmid D., Mutz I., Wewalka G., Allerberger F., Yang J.-Y., Huemer H.P. Epidemiology of enterovirus types causing neurological disease in Austria 1999-2007: detection of clusters of echovirus 30 and enterovirus 71 and analysis of prevalent genotypes // J. Med. Virol. 2009. V. 81. P. 317–324.Ortner B., Huang C.-W., Schmid D., Mutz I., Wewalka G., Allerberger F., Yang J.-Y., Huemer H.P. Epidemiology of enterovirus types causing neurological disease in Austria 1999-2007: detection of clusters of echovirus 30 and enterovirus 71 and analysis of prevalent genotypes // J. Med. Virol. 2009. V. 81. P. 317–324.Щербатов А.Ф., Иванова Л.К. Государственный доклад «О санитарно-ýпидемиологической обстановке и соблюдении законодательства в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека в Новосибирской области в 2010 г.»Shcherbatov A.F., Ivanova L.K. Gosudarstvennyj doklad «O sanitarno-ehpidemiologicheskoj obstanovke i soblyudenii zakonodatel’stva v sfere zashchity prav potrebitelej i blagopoluchiya cheloveka v Novosibirskoj oblasti v 2010 g.» [State report “The sanitary-epidemiological situation and the observance of legislation on protection of consumer rights and human well-being in the Novosibirsk region in 2010”] (in Russian).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.