Genetic diversity of East European and Asian strains of tick-borne encephalitis virus belonging to Siberian genotype
https://doi.org/10.20538/1682-0363-2006--24-35
Abstract
We have studied 40 strains of tick-borne encephalitis virus attributed to Siberian genotype. The fragment of E gene (211 nt) has been sequenced for all strains. Futher analysis has evidenced the formation of two clusters. One of them includes the strains of East European (EE) origin, the other comprises the strains of Asian origin (A). 17 of 20 East European strains have histidin (H) in amino acid position 234 of gene E, the remaining 3 have either glutamine (Q) or tyrosine (Y). 13 Asian strains have histidine and 7 Asian strains have glutamine in amino acid position 234.
About the Authors
L. S. Karan
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Russian Federation
Russian Federation
V. V. Pogodina
Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова РАМН
Russian Federation
Russian Federation
T. V. Frolova
Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова РАМН
Russian Federation
Russian Federation
A. Ye. Platonov
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Russian Federation
Russian Federation
References
1. Вотяков В.И., Злобин В.И., Мешаева Н.П. Клещевые энцефалиты Евразии. Новосибирск: Наука, 2002. 438 с.
2. Злобин В.И., Беликов С.И., Джиоев Ю.П. и др. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита. Иркутск: РИО ВСНЦ СО РАМН, 2003. 272 с.
3. Иерусалимский А.П. Клещевой энцефалит. Новосибирск: Гос. мед. академия МЗ РФ, 2001. 360 с.
4. Коренберг Э.И., Ковалевский Ю.В. Районирование ареала вируса клещевого энцефалита. М., 1981. 148 с.
5. Краминская Н.Н., Живоляпина Р.Р., Мейерова Р.А. Опыт вирусологического изучения гиперкинетических форм клещевого энцефалита с прогредиентным течением // Актуальные проблемы вирусологии и профилактики вирусных заболеваний. М., 1972. С. 224—225.
6. Левкович Е.Н. Вирусологические и иммунологические исследования вспышки энцефалита в Ленинградской области // Весенне-летний энцефалит в Ленинградской области. Л., 1945. С. 82—93.
7. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Карань Л.С. и др. Сибирский и дальневосточный подтипы вируса клещевого энцефалита в европейских и азиатских регионах России: генетическая и антигенная характеристика штаммов // Вопр. вирусологии. 2004. № 4. С. 20—25.
8. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Карань Л.С. и др. Сравнительный анализ вирулентности сибирского и дальневосточного подтипов вируса клещевого энцефалита на основе экспериментальных и клинических данных // Вопр. вирусологии. 2004. № 6. С. 24—30.
9. Gritsun T.S., Venugopal K., Zanotto M. et al. Complete sequence of two tick-borne flaviviruses isolated from Siberia and the UK: analysis and significance of the 5’ and 3’ UTRs // Virus. Res. 1997. Vol. 49. P. 27—30.
10. Gritsun T.S., Frolova T.V., Zhankov A.I. et al. Characterization of a Siberian virus isolated from a patient with progressive chronic tick-borne encephalitis // J. Virol. 2003. Vol. 7. P. 25—36.
Review
For citations:
Karan L.S., Pogodina V.V., Frolova T.V., Platonov A.Ye. Genetic diversity of East European and Asian strains of tick-borne encephalitis virus belonging to Siberian genotype. Bulletin of Siberian Medicine. 2006;5:24-35. (In Russ.) https://doi.org/10.20538/1682-0363-2006--24-35
Views:
431
Email this article 