МУЛЬТИЛОКУСНОЕ СИКВЕНСТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE, ВЫДЕЛЕННЫХ У ПАЦИЕНТОВ ПОЖИЛОГО ВОЗРАСТА С ВНЕБОЛЬНИЧНЫМИ ПНЕВМОНИЯМИ
https://doi.org/10.20538/1682-0363-2014-3-40-45
Аннотация
Внебольничные пневмонии у лиц пожилого возраста являются значимой эпидемиологической проблемой для здравоохранения практически всех стран. Особенно актуальна проблема микробиологического мониторинга и эпидемиологического надзора за штаммами Streptococcuspneumoniae, как одного из убиквитарных возбудителей, вызывающих внебольничные пневмонии и другие инфекции дыхательных путей различной степени тяжести, что определяется их различной эпидемической значимостью.
Мультилокусное сиквенстипирование – перспективный метод молекулярно-эпидемиологического мониторинга, позволяющего идентифицировать эпидемически опасные клоны S. pneumoniae. Целью исследования являлось проведение мультилокусного сиквенстипирования штаммов пневмококка, выделенных у пациентов с внебольничными пневмониями, бронхитами и у носителей пожилого возраста.
Материал и методы. Было проведено исследование 14 штаммов, выделенных у пациентов с внебольничными пневмониями (из них 7 полирезистентных), 8 штаммов от пациентов с хронической обструктивной болезнью легких, 4 штамма от носителей. Мультилокусное сиквенстипирование было проведено согласно методике M.C. Enright и B.G. Spratt (1998).
Результаты. Все штаммы, выделенные в трех популяциях, представляют собой родственные изоляты вида S. pneumoniae, большинство из которых (18 из 26) обладают уникальным генотипом, определяющим наличие одного сиквенстипа для каждого штамма. Из 14 штаммов, выделенных у лиц пожилого возраста с внебольничной пневмонией, 6 относились к профилю Taiwan19F-14. Среди штаммов, выделенных от носителей, превалировал штамм, идентичный штамму R6. Среди штаммов, выделенных от пациентов с хронической обструктивной болезнью, превалирования какого-либо генотипа не выявлено.
Заключение. Мультилокусное сиквенстипирование позволяет идентифицировать новые генотипы и дать прогноз относительно появления эпидемически опасных штаммов с новыми свойствами.
Об авторах
А. В. МартыноваРоссия
Доктор медицинских наук, кафедра эпидемиологии и военной эпидемиологии, Тихоокеанский ГМУ, кафедра биохимии, микробиологии и биотехнологии, Школа естественных наук, Дальневосточный федеральный университет
Л. А. Балабанова
Россия
Кандидат биологических наук, лаборатория морской биохимии
О. А. Чулакова
Россия
Аспирант кафедры эпидемиологии и военной эпидемиологии
Список литературы
1. Бачинская Е.Н. Возбудители внебольничных пневмоний на пороге нового тысячелетия // Антибиотики и химиотерапия. 2000. № 45. С. 21–28.
2. Богданов М.Б., Черненькая Т.В. Микробиологическая оценка антибактериальных препаратов, используемых для эмпирической терапии внебольничных инфекций нижних дыхательных путей // Антибиотики и химиотерапия. 2000. № 10. С. 15–19.
3. Жильцов И.В., Семёнов В.М. Бета-лактамазная активность мокроты и ее влияние на эффективность антибактериальной терапии // Туберкулез и болезни легких. 2012. № 4. С. 18–26.
4. Новиков Ю.К. Диагностика и лечение внебольничных пневмоний // РМЖ. 2001. № 1. С. 11–16.
5. Об унификации микробиологических (бактериологических) методов исследования, применяемых в клинико-диагностических лабораториях лечебно-профилактических учреждений: приказ МЗ СССР № 535 от 22 апреля 1985 г.
6. Семенов В.М., Дмитраченко Т.И., Жильцов И.В. Микробиологические аспекты резистентности к антимикробным препаратам // Туберкулез и болезни легких. 2012. № 4. С. 18–26.
7. Синопальников А.И., Страчунский Л.С. Новые рекомендации по ведению взрослых пациентов с внебольничной пневмонией // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2001. № 1. С. 18–21.
8. Enright M.C., Spratt B.G. A multilocus sequence typing scheme for Streptococcus pneumoniae identification of clones association with serious invasive disease // Microbiology. 1998. Р. 1445049–1445060.
9. Streptococcus pneumoniae. Textbook in Serotyping, Virulence Factors and Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA) for Measuring Pneumococcal Antibodies. Statens Serum Institute, Copenhagen, Denmark, 2013. 34 p.
Рецензия
Для цитирования:
Мартынова А.В., Балабанова Л.А., Чулакова О.А. МУЛЬТИЛОКУСНОЕ СИКВЕНСТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE, ВЫДЕЛЕННЫХ У ПАЦИЕНТОВ ПОЖИЛОГО ВОЗРАСТА С ВНЕБОЛЬНИЧНЫМИ ПНЕВМОНИЯМИ. Бюллетень сибирской медицины. 2014;13(3):40-45. https://doi.org/10.20538/1682-0363-2014-3-40-45
For citation:
Martynova A.V., Balabanova L.A., Chulakova O.A. MULTILOCI SEQUESTERANT STRAINS OF STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE ISOLATED FROM ELDERLY PATIENTS WITH COMMUNITY ACQUIRED PNEUMONIA. Bulletin of Siberian Medicine. 2014;13(3):40-45. (In Russ.) https://doi.org/10.20538/1682-0363-2014-3-40-45