В оценке журналов приняли участие более 20 тысяч ученых, а при принятии решения о включении или исключении журнала из состава RSCI учитывались более 50 библиометрических показателей и статистических отчетов за последние восемь лет, а также общественная экспертиза журналов ведущими российскими учеными.

Экспертная оценка журналов проводилась в соответствии с такими критериями, как стабильность качества публикаций, научный уровень, состав редколлегии, актуальность, оформление журнала (в том числе корректность ссылок) и соблюдение издательской и научной этики. Недобросовестные практики в деятельности журналов — фактическое отсутствие или избирательное рецензирование, некорректные заимствования или повторные публикации уже опубликованных текстов под тем же или другим авторством, договорное или перекрестное цитирование, накрутка показателей и т.д., — оценивались по материалам Диссернет и НЭБ.