ОСОБЕННОСТИ МИКРОБИОТЫ КИШЕЧНИКА У БОЛЬНЫХ ХРОНИЧЕСКОЙ ОБСТРУКТИВНОЙ БОЛЕЗНЬЮ ЛЕГКИХ
https://doi.org/10.20538/1682-0363-2014-5-55-61
Аннотация
В статье обобщены результаты исследований, посвященных изучению состава сообщества микроорганизмов в образцах кала больных хронической обструктивной болезнью легких (ХОБЛ) и здоровых добровольцев методом полногеномного метагеномного секвенирования. Показано, что сообщество микроорганизмов кишечника у пациентов с ХОБЛ характеризуется столь же разнообразным таксономическим составом метагеномов, что и микробиота здоровых добровольцев. При этом нормальный состав кишечной микробиоты у больных ХОБЛ подвергается качественной и количественной модификации. В отличие от здоровых добровольцев, кишечная микробиота у больных ХОБЛ характеризуется присутствием таких представителей Proteobacteria, как Citrobacter, Enterobacter, Eggerthella, Proteus,Salmonella, Anaerococcus, Clostridium difficile, Pseudomonas, а также более высокой обсемененностью грибками рода Candida (Candida dubliniensis и Candida albicans).
Об авторах
А. М. ОгородоваРоссия
Огородова Людмила Михайловна — доктор медицинских наук, профессор, член-корреспондент РАМН, зав. кафедрой факультетской педиатрии с курсом детских болезней лечебного факультета СибГМУ, заместитель министра науки и образования Российской Федерации
В. М. Говорун
Россия
Говорун Вадим Маркович — доктор биологических наук, профессор, член-корреспондент РАН, заместитель директора по научной работе
С. В. Федосенко
Россия
Федосенко Сергей Вячеславович — кандидат медицинских наук, докторант кафедры госпитальной терапии с курсом физической реабилитации и спортивной медицины
М. А. Картушкина
Россия
Карнаушкина Мария Александровна — кандидат медицинских наук, ассистент кафедры пульмонологии �ой реабилитации и спортивной медицины :City>
И. В. Салтыкова
Россия
Салтыкова Ирина Владимировна — кандидат медицинских наук, младший научный сотрудник Центральной научно-исследовательской лаборатории
Д. Г. Алексеев
Россия
лексеев Дмитрий Глебович — кандидат биологических наук, зав. лабораторией биоинформатики span>
Е. С. Кострюкова
Россия
Кострюкова Елена Сергеевна — кандидат биологических наук, зав. лабораторией постгеномных исследований в биологии НИИ физико-химической медицины
А. В. Тяхт
Россия
Тяхт Александр Викторович — младший научный сотрудник лаборатории биоинформатики
А. С. Попенко
Россия
Попенко Анна Сергеевна — аспирант, лаборант лаборатории биоинформатики
Список литературы
1. Abt M.C., Artis D. The intestinal microbiota in health and disease: the influence of microbial products on immune cell homeostasis // Curr. Opin. Gastroenterol. 2009. 25. P. 496–502.
2. Staley J.T., Konopka A. Measurement of in situ activities of nonphotosynthetic microorganisms in aquatic and terrestrial habitats // Annu. Rev. Microbiol. 1985. 39. P. 321–346.
3. Global Initiative for Chronic Obstructive Lung Disease (GOLD). URL: http://www.goldcopd.org/uploads/users/fi-les/GOLD_Report_2011_Feb21.pdf
4. Hooper L.V., Gordon J.I. Commensal host-bacterial rela-tionships in the gut // Science. 2001. 292. P. 1115–1118.
5. Tyakht A.V., Kostryukova E.S., Popenko A.S., Belenikin M.S., Pavlenko A.V., Larin A.K., Govorun V.M. Human gut microbiota community structures in urban and rural popula-tions in Russia // Nat. Commun. 2013. 4.
6. De Filippo C., Cavalieri D., Di Paola M., Ramazzotti M., Poullet J.B., Massart S., Collini S., Pieraccini G., Lionetti P. Impact of diet in shaping gut microbiota revealed by a com-parative study in children from Europe and rural Africa // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2010. 107 (33). P. 14691–14696.
7. Arumugam М., Raes J., Pelletier E., Le Paslier D. et al. Enterotypes of the human gut microbiome // Nature. 2011. 12, 473 (7346). P. 174–180.
8. Joseph N., Paulson O., Colin Stine, Héctor Corrada Bravo, Mihai Pop. Differential abundance analysis for microbial marker-gene surveys // Nat. Methods. 2013. 10 (12). P. 1200–1202.
Рецензия
Для цитирования:
Огородова А.М., Говорун В.М., Федосенко С.В., Картушкина М.А., Салтыкова И.В., Алексеев Д.Г., Кострюкова Е.С., Тяхт А.В., Попенко А.С. ОСОБЕННОСТИ МИКРОБИОТЫ КИШЕЧНИКА У БОЛЬНЫХ ХРОНИЧЕСКОЙ ОБСТРУКТИВНОЙ БОЛЕЗНЬЮ ЛЕГКИХ. Бюллетень сибирской медицины. 2014;13(5):55-61. https://doi.org/10.20538/1682-0363-2014-5-55-61
For citation:
Ogorodova L.M., Govorun V.M., Fedosenko S.V., Karnaushkina M.A., Saltykova I.V., Alekseyev D.G., Kostrytikova Ye.S., Tyakht A.V., Popenko A.S. FEATURES OF THE INTESTINAL MICROBIOTA IN PATIENTS WITH CHRONIC OBSTRUCTIVE PULMONARY DISEASE. Bulletin of Siberian Medicine. 2014;13(5):55-61. (In Russ.) https://doi.org/10.20538/1682-0363-2014-5-55-61