Генетические различия восточноевропейской и азиатской популяций вируса клещевого энцефалита сибирского подтипа
https://doi.org/10.20538/1682-0363-2006--24-35
Аннотация
Исследованы 40 штаммов вируса клещевого энцефалита, относящиеся к сибирскому генотипу. Анализ нуклеотидной последовательности участка гена Е длиной 211 н.п. показал формирование двух кластеров. Один из них объединяет штам- мы восточноевропейского топоварианта (ВЕ), другой — азиатского (А). В 234-м аминокислотном положении гена Е у 17 из 20 исследованных штаммов ВЕ топоварианта находится гистидин (H), у остальных трех — глутамин (Q) или тирозин (Y). Среди 20 штаммов азиатского топоварианта у 13 в позиции 234 присутствует гистидин (H), у 7 — глутамин (Q).
Об авторах
Л. С. Карань
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Россия
Россия
В. В. Погодина
Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова РАМН
Россия
Россия
Т. В. Фролова
Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П. Чумакова РАМН
Россия
Россия
А. Е. Платонов
Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора
Россия
Россия
Список литературы
1. Вотяков В.И., Злобин В.И., Мешаева Н.П. Клещевые энцефалиты Евразии. Новосибирск: Наука, 2002. 438 с.
2. Злобин В.И., Беликов С.И., Джиоев Ю.П. и др. Молекулярная эпидемиология клещевого энцефалита. Иркутск: РИО ВСНЦ СО РАМН, 2003. 272 с.
3. Иерусалимский А.П. Клещевой энцефалит. Новосибирск: Гос. мед. академия МЗ РФ, 2001. 360 с.
4. Коренберг Э.И., Ковалевский Ю.В. Районирование ареала вируса клещевого энцефалита. М., 1981. 148 с.
5. Краминская Н.Н., Живоляпина Р.Р., Мейерова Р.А. Опыт вирусологического изучения гиперкинетических форм клещевого энцефалита с прогредиентным течением // Актуальные проблемы вирусологии и профилактики вирусных заболеваний. М., 1972. С. 224—225.
6. Левкович Е.Н. Вирусологические и иммунологические исследования вспышки энцефалита в Ленинградской области // Весенне-летний энцефалит в Ленинградской области. Л., 1945. С. 82—93.
7. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Карань Л.С. и др. Сибирский и дальневосточный подтипы вируса клещевого энцефалита в европейских и азиатских регионах России: генетическая и антигенная характеристика штаммов // Вопр. вирусологии. 2004. № 4. С. 20—25.
8. Погодина В.В., Бочкова Н.Г., Карань Л.С. и др. Сравнительный анализ вирулентности сибирского и дальневосточного подтипов вируса клещевого энцефалита на основе экспериментальных и клинических данных // Вопр. вирусологии. 2004. № 6. С. 24—30.
9. Gritsun T.S., Venugopal K., Zanotto M. et al. Complete sequence of two tick-borne flaviviruses isolated from Siberia and the UK: analysis and significance of the 5’ and 3’ UTRs // Virus. Res. 1997. Vol. 49. P. 27—30.
10. Gritsun T.S., Frolova T.V., Zhankov A.I. et al. Characterization of a Siberian virus isolated from a patient with progressive chronic tick-borne encephalitis // J. Virol. 2003. Vol. 7. P. 25—36.
Рецензия
Для цитирования:
Карань Л.С., Погодина В.В., Фролова Т.В., Платонов А.Е. Генетические различия восточноевропейской и азиатской популяций вируса клещевого энцефалита сибирского подтипа. Бюллетень сибирской медицины. 2006;5:24-35. https://doi.org/10.20538/1682-0363-2006--24-35
For citation:
Karan L.S., Pogodina V.V., Frolova T.V., Platonov A.Ye. Genetic diversity of East European and Asian strains of tick-borne encephalitis virus belonging to Siberian genotype. Bulletin of Siberian Medicine. 2006;5:24-35. (In Russ.) https://doi.org/10.20538/1682-0363-2006--24-35
Просмотров:
432
Послать статью по эл. почте 