Preview

Бюллетень сибирской медицины

Расширенный поиск

Особенности таксономической принадлежности бактериальной ДНК крови у пациентов с различными метаболическими фенотипами ожирения

https://doi.org/10.20538/1682-0363-2023-2-61-67

Аннотация

Цель. Изучить таксономический состав микробиома крови у пациентов со следующими фенотипами: метаболически здоровым ожирением (МЗО) и метаболически нездоровым ожирением (МНЗО).

Материалы и методы. В исследование включены здоровые доноры без ожирения (n = 116) и пациенты с ожирением, которые были разделены на подгруппы с МЗО (n = 36) и МНЗО (n = 53). Из образцов венозной крови выделяли бактериальную ДНК и проводили метагеномное секвенирование вариабельного участка v3–v4 гена 16S рРНК. Сравнивалась как частота выделения отдельных таксонов из образцов, так и доля, приходящаяся на эти таксоны в общем пуле бактериальной ДНК крови.

Результаты. Для пациентов с МНЗО было характерно увеличение доли Lachnospiraceae, Ruminococcaceae и Prevotellaceae, которые являются основными представителями кишечной микробиоты, что может являться следствием большей кишечной проницаемости, характерной для таких пациентов. Вне зависимости от метаболического фенотипа у пациентов с ожирением из образцов крови чаще выделялась ДНК Rhodobacteraceae, Streptomycetaceae, Leuconostocaceae и Burkholderiaceae. При МЗО также чаще обнаруживалась в крови ДНК Nocardioidaceae, Flavobacteriaceae, Hyphomicrobiaceae и Gaiellaceae, а у пациентов с МНЗО – S24-7, Nocardiaceae и Helicobacteraceae. Многие представители этих семейств являются обитателями почв и вод, что может свидетельствовать об усилении проницаемости кожного барьера у пациентов с ожирением. Также большая представленность Helicobacteraceae у пациентов с МНЗО может указывать на усиление транслокации из желудка.

Заключение. Ожирение приводит к выраженным изменениям в таксономическом составе микробиома крови, при этом характер изменений зависит от метаболического фенотипа ожирения и проницаемости внешних барьеров.

Об авторах

И. М. Колесникова
Российский национальный исследовательский медицинский университет (РНИМУ) им. Н.И. Пирогова
Россия

Колесникова Ирина Максимовна – ст. преподаватель,

117997, г. Москва, ул. Островитянова, 1



М. С. Карбышев
Российский национальный исследовательский медицинский университет (РНИМУ) им. Н.И. Пирогова
Россия

Карбышев Михаил Сергеевич – канд. биол. наук, доцент, 

117997, г. Москва, ул. Островитянова, 1



A. M. Гапонов
Общество с ограниченной ответственностью «Центр молекулярного здоровья» (ООО «ЦМЗ»); Федеральный научно-клинический центр реаниматологии и реабилитологии (ФНКЦ РР) им. В.А. Неговкого
Россия

Гапонов Андрей Михайлович – канд. мед. наук, зав. отделом, 117218, г. Москва, пр. Нахимовский, 32;

вед. науч. сотрудник, 107031, г. Москва, ул. Петровка, 25/2



Д. Р. Хуснутдинова
Казанский (Приволжский) федеральный университет (КФУ)
Россия

Хуснутдинова Диляра Рашидовна – мл. науч. сотрудник, 

420008, г. Казань, ул. Кремлевская, 18



Т. В. Григорьева
Казанский (Приволжский) федеральный университет (КФУ)
Россия

Григорьева Татьяна Владимировна – канд. биол. наук, ст. науч. сотрудник, 

420008, г. Казань, ул. Кремлевская, 18



Д. Р. Камальдинова
Казанский (Приволжский) федеральный университет (КФУ)
Россия

Камальдинова Диляра Равильевна – науч. сотрудник, 

420008, г. Казань, ул. Кремлевская, 18



О. В. Борисенко
Российский национальный исследовательский медицинский университет (РНИМУ) им. Н.И. Пирогова
Россия

Борисенко Ольга Владимировна – канд. мед. наук, доцент, 

117997, г. Москва, ул. Островитянова, 1



В. В. Макаров
Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью
Россия

Макаров Валентин Владимирович – канд. биол. наук, зав. отделом, 

119121, г. Москва, Погодинская, 10/1



С. М. Юдин
Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью
Россия

Юдин Сергей Михайлович – д-р мед. наук, профессор, генеральный директор,

119121, г. Москва, Погодинская, 10/1



С. А. Румянцев
Российский национальный исследовательский медицинский университет (РНИМУ) им. Н.И. Пирогова; Общество с ограниченной ответственностью «Центр молекулярного здоровья» (ООО «ЦМЗ»)
Россия

Румянцев Сергей Александрович – д-р мед. наук, профессор, член-корр. РАН, директор, 117218, г. Москва, пр. Нахимовский, 32;

зав. кафедрой онкологии, гематологии и лучевой терапии, 117997, г. Москва, ул. Островитянова, 1



А. В. Шестопалов
Российский национальный исследовательский медицинский университет (РНИМУ) им. Н.И. Пирогова; Общество с ограниченной ответственностью «Центр молекулярного здоровья» (ООО «ЦМЗ»); Национальный медицинский исследовательский центр детской гематологии, онкологии и иммунологии (НМИЦ ДГОИ) им. Дмитрия Рогачева
Россия

Шестопалов Александр Вячеславович – д-р мед. наук, профессор, зам. директора, 117218, г. Москва, пр. Нахимовский, 32;

директор управления последипломного образования, ординатуры, аспирантуры, 117997, г. Москва, ул. Саморы Машела, 1, ГСП-7;

зав. кафедрой биохимии и молекулярной биологии, 117997, г. Москва, ул. Островитянова, 1



Список литературы

1. Nikkari S., McLaughlin I.J., Bi W., Dodge D.E., Relman D.A. Does blood of healthy subjects contain bacterial ribosomal DNA? J. Clin. Microbiol. 2001;39(5):1956–1959. DOI: 10.1128/JCM.39.5.1956-1959.2001.

2. Федоров Н.А., Елов А.А., Жибурт Е.Б., Суханов Ю.С., Круглов A.Н., Стоногин А.В. и др. Частота обнаружения бактериальной ДНК в цельной крови доноров. Доклады Академии наук. 2005;402(6):841–843. DOI: 10.1007/s10630-005-0085-y.

3. Castillo D.J., Rifkin R.F., Cowan D.A., Potgieter M. The healthy human blood microbiome: Fact or fiction? Front. Cell. Infect. Microbiol. 2019;9:1–12. DOI: 10.3389/fcimb.2019.00148.

4. Гапонов А.М., Волкова Н.И., Ганенко Л.А., Набока Ю.Л., Маркелова М.И., Синягина М.Н. и др. Особенности микробиома толстой кишки у пациентов с ожирением при его различных фенотипах (оригинальная статья). Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2021;98(2):144–155. DOI: 10.36233/0372-9311-66.

5. Котрова А.Д., Шишкин А.Н., Воропаева Л.С., Лавренова Н.С., Слепых Л.А., Лукашенко М.В. и др. Гендерная оценка микробиома кишечника у больных с ожирением. Клиническая гастроэнтерология. 2021;(10):91–99. DOI: 10.31146/1682-8658-ecg-194-10-91-99.

6. Шестопалов А.В., Колесникова И.М., Гапонов А.М., Григорьева Т.В., Хуснутдинова Д.Р. Камальдинова Д.Р. и др. Влияние метаболического типа ожирения на микробиом крови. Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии. 2022;25(2):35–41. DOI: 10.29296/25877313-2022-02-06.

7. Massier L., Blüher M., Kovacs P., Chakaroun R.M. Impaired intestinal barrier and tissue bacteria: pathomechanisms for metabolic diseases. Front. Endocrinol. (Lausanne). 2021;12(March):1–18. DOI: 10.3389/fendo.2021.616506.

8. Iacobini C., Pugliese G., Blasetti Fantauzzi C., Federici M., Menini S. Metabolically healthy versus metabolically unhealthy obesity. Metabolism. Elsevier Inc. 2019;92:51–60. DOI: 10.1016/j.metabol.2018.11.009.

9. Phillips C.M. Metabolically healthy obesity: Definitions, determinants and clinical implications. Rev. Endocr. Metab. Disord. 2013;14(3):219–227. DOI: 10.1007/s11154-013-9252-x.

10. Hirt P.A., Castillo D.E., Yosipovitch G., Keri J.E. Skin changes in the obese patient. J. Am. Acad. Dermatol. 2019;81(5): 1037–1057. DOI: 10.1016/j.jaad.2018.12.070.


Рецензия

Для цитирования:


Колесникова И.М., Карбышев М.С., Гапонов A.M., Хуснутдинова Д.Р., Григорьева Т.В., Камальдинова Д.Р., Борисенко О.В., Макаров В.В., Юдин С.М., Румянцев С.А., Шестопалов А.В. Особенности таксономической принадлежности бактериальной ДНК крови у пациентов с различными метаболическими фенотипами ожирения. Бюллетень сибирской медицины. 2023;22(2):61-67. https://doi.org/10.20538/1682-0363-2023-2-61-67

For citation:


Kolesnikova I.M., Karbyshev M.S., Gaponov A.M., Khusnutdinova D.R., Grigoryeva T.V., Kamaldinova D.R., Borisenko O.V., Makarov V.V., Yudin S.M., Roumiantsev S.A., Shestopalov A.V. Features of bacterial DNA taxonomy in blood of patients with various metabolic phenotypes of obesity. Bulletin of Siberian Medicine. 2023;22(2):61-67. https://doi.org/10.20538/1682-0363-2023-2-61-67

Просмотров: 411


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1682-0363 (Print)
ISSN 1819-3684 (Online)